MCB 182 Lecture 10.8 - Choosing 3C assay, genome assembly with Hi-C

MCB 182 Lecture 10.8 - Choosing 3C assay, genome assembly with Hi-C

Considerations about how to choose between 3C/4C/Hi-C, and also a brief discussion of how Hi-C can be used for genome assembly purposes. MCB 182: Introduction to Genomics lecture videos Course playlist:    • MCB 182: Introduction to Genomics lecture ...  

ภาพตัวอย่างวิดีโอ
MCB 182 Lecture 10.8 - Choosing 3C assay, genome assembly with Hi-C
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
MCB 182 Lecture 10.3 - Chromatin conformation capture (3C, 4C) assays
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
MCB 182 Lecture 3.4 - Genome assembly - Scaffolding contigs
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
Bioinformatics for the 3D Genome: An Introduction to Analyzing and Interpreting Hi-C Data
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
MCB 182 Lecture 11.1 - Introduction to molecular interaction networks
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
Arima Hi-C | Hi-C Method | Conformation Capture |
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
MCB 182 Lecture 10.2 - DamID for mapping protein-DNA interactions
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
Achieving Chromosome-Scale Assemblies with Arima Hi-C
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
Proximo Hi-C Genome Scaffolding | Proximity Ligation for Genome Scaffolding | Hi-C Method |
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
Chromatin Conformation Capture | Chromosome Conformation Capture Assay | Hi-C Method |
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
Lecture 34: Nucleosomes as barriers, Hi-C, and contact probabilities
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
N. Guiglielmoni, "Hic2gfa: phasing assembly graphs with chromosome conformation capture"
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
The Chromatin Conformation Capture (3C) Assay (Recommend 1.5x Speed)
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
ANZ PacBio Workshop Series, Day 1: genome assembly
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
MCB 182 Lecture 10.7 - Chromatin looping, loop extrusion model
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
Arima-HiC: A simple and robust Hi-C workflow
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
5-C | Chromosome Conformation Capture Carbon Copy | 3C Vs 4C |
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
Module 4c Sequence Reports
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
Chromosome conformation capture method
ภาพตัวอย่างวิดีโอ
Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale... - Jay Ghurye - ISMB 2018 Hitseq